GhostShipВы слишком усложняете все.
1. В любом окошке где вы раньше вводили значения в пикселях ткните правой кнопкой, и выберете другие единицы измерения.
2. Кисти Вам в 90% случаев не понадобятся.
3. Коли знаете что такое фильтр, то ретушь изображения сможете сделать, на форуме есть рецепты.
4. Наверняка Вы знаете что по Ctrl-R включатся линейки, и как можно выставить направляющие.
5. Наверняка Вы знаете что такое прямоугольное выделение. Так вот у него есть режим "заданный размер".
6. Вы так же наверняка знаете, что направляющие прилипают к текущему выделению, а выделение к направляющим.
7. И 100% знаете как нарисовать карандашом линию в 1 пиксель.
Это все что Вам понадобится. Просто нужно немного сменить парадигму восприятия программы
PS Я нисколько не уговариваю Вас делать вещи именно в Фотошопе. В конце концов векторные редакторы поддерживают многостраничные документы, а это лишение гемора при конвертировании в pdf/