Если читать новые сообщения в темах, но не "снизу вверх", а в произвольном порядке, то у более "нижних" тем в разделе форума пропадают значки новых сообщений справа от названия темы, как будто ту тему уже прочитал.
Почистил кэш браузера. Вроде бы проблема решилась.