В общем я немного экспериментировал с картами карточного ужаса аркхэма, если набрать достаточно много карт, и так чтоб они были тёмные, и наложить друг на друга в режиме затемнения, то можно выделить частично водяной знак. Для карточного это практически получилось. он удаляется остаётся лишь небольшой шум, который можно уже задавить. правда это ещё от сжатия jpeg зависит.
Покажите с каких карт вы хотите удалить водяной знак, возможно тот что я выделил частично подойдёт.